アタックチーム編成画面にある「偵察」コマンドを実行することで、これから戦うフィールドと敵の編成（配置、レベル、クラス、装備内容など）を確認することができます。
アタックチーム編成画面ではユニットのクラスチェンジや装備内容の変更が可能なので、地形や敵の情報を参考に、効果的なアタックチームを編成しましょう。

出撃ユニット数やクラスの構成など、バトルのシチュエーションに応じてアタックチームの編成パターンを登録しておくことで、「偵察」で得た情報を踏まえ、最適なユニット編成をすぐに選んでバトルに挑むことができます。

バトル中、ユニットが強化できるアイテム「バフカード」がフィールドに出現します。
ユニットがバフカードを拾うことで「攻撃力のアップ」や「クリティカル発生率のアップ」など、そのバトル中のみカードの内容に応じた効果を発揮します。

自軍・敵軍のユニットはこのバフカードを取り合い、バトルを相手よりも有利に進められるようにどういった動きや対応をしていくかが、今作ならではのバトルの醍醐味になります。
バフカードは１ユニット最大４つまでスタックでき、同系の効果を持つパフカードをスタックするほど効果が跳ね上がり、戦況がダイナミックに変わっていきます。

バトルのクリア条件とは別に新たに「ボーナスタスク」を導入しました。
バトルごとに「アタックチームにナイトを入れて勝利」「バフカードを獲得」といった目標が提示され、見事達成するとチャームや武具など自軍の強化につながるアイテムを獲得できます。

自軍ユニットをオートで動かす際のAIタイプを「鬼神の如く戦え」「堪え忍び機を伺え」「宵闇に潜み狙え」「儚き生命を救え」の4種類を用意しました。アタックチーム編成画面やバトル中に自軍の全ユニットを対象に一括でAIによるオート操作、もしくは手動操作に切り替える便利機能もあります。

弓やボウガンなどによる遠隔攻撃、直線弾道で投射される魔法（デッドショットなど）を使用する際に軌道予測を表示し、自軍への誤射なく攻撃対象を狙えるかを確認できます。

敵から攻撃を受けてHPが0になると戦闘不能になります。戦闘不能のユニットの頭上には数字（戦闘不能カウント）が表示され、カウントが0になる前であれば、消耗品や魔法で何度でも蘇生可能です。
蘇生したユニットは復活後すぐに行動できるため、移動やHP回復などで状況を立て直すことができます。
カウントが0になると「死亡」となり、2度と復活させることはできなくなるので注意が必要です。

ワールドマップ上で移動時にランダムで発生したエンカウントバトルを廃止し、特定の拠点で任意で行える「演習」を導入。演習でユニットが死亡することはなく、ユニットのレベリング作業をより行いやすくなりました。

バトルで使用したHP回復などの消耗品アイテムは、自軍にストックがあると、バトル終了後にそのアイテムを使用したユニットに対して自動で補充されます。

自軍全体のレベルであり、そのレベルがユニットのレベル上限となるレベルキャップシステムとなります。ユニオンレベルの上限は、シナリオ進行に合わせて徐々に開放されますが、レベルを極端に上げて力押しで戦いに挑むことはできません。ユニオンレベルの導入によって、戦術ゲームとしてのユニットの活用が重要になります。
ただし、序盤から中盤にかけてユニオンレベルは敵ユニットのレベルよりもやや高く設定されているので、レベルを上げることで難易度が極端に高く感じることはなくなります。

レベルは、演習やチャームなどで手軽に上げることができますので、はじめてプレイされる方も安心してお楽しみいただけます。

装備品等の売買の際には、現在の所持数やどのユニットが装備しているかなどの情報も確認できます。

武具や消耗品の性能を強化できる「合成」は、常に100％成功するようになり、失敗等のやり直しやアイテムロストはありません。また、複数アイテムをまとめて合成する便利機能も追加されました。

特定のダンジョンで手に入る武具の中には、「レリック」と呼ばれる通常とは異なる性質を持つものがあります。
同名のレリックは、ショップにて掛け合わせて攻撃種、エレメント、種族に対する耐性パラメーターを強化することができます。強化を重ね、より強い敵への戦いに挑みましょう。

※「レリック」は同じ名称でも性能の異なるものが存在します。
※「レリック」の各耐性パラメーターには上限があります。

「運命の輪 C.H.A.R.I.O.T.」は、記録されている行動を任意のターンまでさかのぼってプレイをやり直すことができます。１バトル中に「運命の輪 C.H.A.R.I.O.T.」で巻き戻せる手数は決まっており、序盤は10ターン前までですが、ゲームの進行に合わせて増えていきます。
結果を変えたい場合は、巻き戻して行動を変化させてみましょう。

条件を満たすと使用できるようになる「運命の輪 W.O.R.L.D.」は、物語の特定のポイントに時を戻してこれまで進んできた道とは違うルートを選ぶことが可能になります。

「レベルシンク」は敵軍に対して自軍の戦力が勝っている場合に、敵軍のレベルに合わせて自軍ユニットのレベルを調整する機能です。これにより「運命の輪 W.O.R.L.D.」で時間をさかのぼっても、戦力の大きな差はなくなり緊張感のあるバトルを楽しむことができます。
レベルシンクは未攻略のバトルステージに適用され、クリア済みのステージでは一部を除いて、レベルシンクのオン/オフを任意で切り替えることができます。レベルシンクが適用されたバトルでは、これまでに手に入れた強力な武具、魔法、スキルを装備させることで、バトルを有利に進められるため難易度が高くなりすぎることはありません。