张帆 ISI产品培训暨教育支持 f.zhang@thomson.com ISI Chemistry 张帆 ISI产品培训暨教育支持 f.zhang@thomson.com.

Presentation on theme: "张帆 ISI产品培训暨教育支持 f.zhang@thomson.com ISI Chemistry 张帆 ISI产品培训暨教育支持 f.zhang@thomson.com."— Presentation transcript:

1 张帆 ISI产品培训暨教育支持 f.zhang@thomson.com
ISI Chemistry 张帆 ISI产品培训暨教育支持

2 提纲 什么是Chemistry？ Chemistry的检索途径 检索实例 小结

3 Chemistry的内容 Chemistry是专门为满足化学与药学研究人员的需求所设计的数据库。收集了全球核心化学期刊和发明专利的所有最新发现或改进的有机合成方法，提供最翔实的化学反应综述和详尽的实验细节，提供化合物的化学结构和相关性质，包括制备与合成方法。 ISI Chemistry是一个事实型的化学数据库。 目前Index Chemicus(IC)和Current Chemical Reactions　(CCR)集成在Web of Science数据库中，可以提供引文方式的检索途径。

4 Current Chemical Reactions
CCR可以跟踪最新的合成技术，包括了摘自39个权威出版机构的一流期刊和专利的单步和多步的新合成方法。每一种方法都提供了完整地反应流程，同时伴有详细精确的图形来代表每个反映步骤。 CCR提供了从 年之间的75多万个反应。月更新3000多条记录。 该数据库还包括来自享有极高声望的国家研究所 de la Propriete Industrielle的14万多条反应纪录，数据可回溯至18世纪。

5 Index Chemicus IC主要聚焦新化合物的快讯报道，包括了来自国际一流期刊报道的新型有机合成反应的结构与评论数据。除此以外，数据库中的很多全记录展示了从最初原材料到最终产品的整个反应流程。IC是揭示生物活性化合物和自然产品的有关最新信息的重要资源。

6 化学结构和化学反应 的事实型数据库：

7 600,000 多个反应 -- ISI (1985-present) 每年增加45,000 多个反应
140,000 个反应 -- INPI ( ) Static file Over 1,500,000 compounds (1991-present) Over 3,800,000 compounds ( ) This is a brief summary of all chemistry data accumulated by ISI

8 ISI Chemistry:Current Chemical Reactions
第一个在互联网Web上全面采用结构与子结构检索的化学反应数据库 第一个可以连接至其它信息资源的化学反应数据库(通过Web of Science) ISI Chemistry: Index Chemicus 最快报道新的有机化合物及其生物活性 唯一的可以用化学子结构检索的信息快讯数据库

9 收录反应的选择标准： 新反应或合成方法 已知反应的新或未知的应用或新的催化剂 已知合成路线的新发展或修饰 天然产物的第一次实验室合成或全合成
1、收集新反应以及已知方法的改进，以提供最新的和最必要的合成方法，从而保证研究人员迅速地找到满足要求的最好的合成路线，避免了在同一反应的大量实例中重复检索。其它数据库，比如BEILSTEIN 试图提供每一个化合物的合成方法，结果导致了大量的重复数据

10 反应类型(%)： 除了传统的有机化学反应以外的反应类型 覆盖面广： 有机化学、生物无机、生物化学 无机化合物在有机合成中的应用-催化剂：
12% Reactions 除了传统的有机化学反应以外的反应类型

11 来源刊，卷，期，页，所有作者名，文献题目，专利号，专利国家，专利日期，Key Word
完整的文献信息 来源刊，卷，期，页，所有作者名，文献题目，专利号，专利国家，专利日期，Key Word 作者摘要，地址 反应图示 反应流程图示，每一步反应，总反应， 反应笔记(突出说明“the State of Art”)

12 完整的反应条件-“合成的菜谱” Time, temperature, atmosphere, pressure, reflux, stoichiometry, concentrations, yield, isomeric composition, reaction keywords, symbols, etc. 其它的条件: Anodic oxidation, vacuum sublimation, sealed tube, Schlenk apparatus, ultraviolet irradiation, one pot, phosphate buffer, pH range, etc.

13 作用： 取得分子合成反应的信息，检查某类分子是否已被分离、合成，有关的文献资料 了解最新的催化剂，各类分子的生物活性、天然来源等信息资料
新的有机金属化合物设计、合成与应用 各种单体分子的合成，催化剂的利用，材料的各种合成途径 了解化合物/药物分子的生物活性，迅速发现潜在的药物母体及其合成；“组合化学”所必需的固相合成反应 缩短项目的研究周期，减少不必要的重复开发，提高工作效率

14 提纲 什么是Chemistry？ Chemistry的检索途径 检索实例 小结

15 Chemistry 中共有四种检索方式 General Search Cited Reference Search
Structure Search Advanced Search

16 选择数据库 使用前先下载免费插件

17 结构检索 使用ISI Chemistry，除了进行主题检索的方式以外，还可以画出化合物结构或化学反应式。用反应物结构式或其亚结构、产物结构式或其亚结构以及反应式进行检索，甚至可以用反应条件和化合物参数进行检索，以迅速准确地发现相关的化学信息。 绘制和显示反应式或结构式都需要下载并安装插件Chemistry Plugin。

18 单击画图

19 绘图软件

20

21

22 反应概要图示 论文记录LINK 反应细节LINK

23 反应流程图示 作者摘要 作者地址 反应细节

24 Reaction Details

25 “salinomycin”/”mycotrien*”
化合物数据检索 “salinomycin”/”mycotrien*” “Antiviral Activity” “340”/”>500” 化合物的角色

26 反应描述：“Diels Alder”/”Ring Closure” 对反应的评价(包括优势、局限性、注意事项及其它定性数据)：
反应数据检索 反应条件： 保护气：Air, O2,N2,Ar etc 反应时间(Hrs)：24/<10 产率(%)：100/>80 压力(Atm)：>1 / >5 and <20 温度(C)：25 / >-40 回流： 其它：Term List . 反应描述：“Diels Alder”/”Ring Closure” 对反应的评价(包括优势、局限性、注意事项及其它定性数据)： COMMERCIAL* AND CHEAP SIMPLE OR EFFICIENT

27 引文索引数据库和ISI Chemistry 的联合使用
利用引文索引数据库的被引文献检索,检索该文献发表以来被引用的情况,从而可以掌握该反应最新的发展 利用引文索引数据库中所提供的该文献的参考文献和相关文献迅速掌握与该反应相关的文献

28 “引文索引可能是最好的化学反应的索引” “Citations make perhaps the best reaction index for the printed literature" precisely because citations are "based on all important features of the reaction, not just the molecular structures or bonds broken and made in the reaction."3 - Wipke W T, Vladutz G. An alternative view of reaction similarity: Citation analysis. Tetrahedron Computer Methodology 3:83-107, 1990

29 Related Records Related Records Related Records Related Records
ENANTIOSELECTIVE ALKYLATION OF PROCHIRAL ALDEHYDES BY DIETHYLZINC PROMOTED BY (S,S)-1,2-DIPHENYLETHAN-1,2-DIOL ROSINI C, FRANZINI L, PINI D, SALVADORI P TETRAHEDRON-ASYMMETRY 1: (9) CATALYZED ENANTIOSELECTIVE ALKYLATION OF ALDEHYDES BOLM C, SCHLINGLOFF G, HARMS K CHEMISCHE BERICHTE-RECUEIL 125: (5) MAY 1992 Related Records Related Records POLYFUNCTIONAL, STRUCTURALLY DEFINED CATALYSTS FOR THE ENANTIOSELECTIVE ADDITION OF DIALKYLZINC REAGENTS TO ALDEHYDES. COREY EJ; YUEN PW; HANNON FJ; WIERDA DA JOURNAL OF ORGANIC CHEMISTRY 55(3), , 1990 Related Records Related Records ENANTIOSELECTIVE ADDITION OF DIALKYLZINCS TO ALDEHYDES USING HETEROGENEOUS CHIRAL CATALYSTS IMMOBILIZED ON ALUMINA AND SILICA-GEL SOAI K, WATANABE M, YAMAMOTO A JOURNAL OF ORGANIC CHEMISTRY 55: (16) AUG NEW SOLID-PHASE CATALYSTS FOR ASYMMETRIC-SYNTHESIS - CROSS-LINKED POLYMERS CONTAINING A CHIRAL SHIFF BASE ZINC COMPLEX ITSUNO S, SAKURAI Y, ITO K, MARUYAMA T, NAKAHAMA S, FRECHET JMJ JOURNAL OF ORGANIC CHEMISTRY 55: (1) JAN

30 科学研究的数字环境 研究实例

31 ： 目标：合成一种具有HIV-1 蛋白酶抑制活性的 化合物 高产率 高光学纯度 合成的有效性 可以买得到的起始原料 没有复杂的纯化过程

32 Initial Query (Text Searching)
Biological Activity (as Product): HIV-1 Protease inhibiting activity 生成物 产率

33 Search Results (Hit List)
Link to Full Record Link to detailed reaction conditions Reaction Overview Search Results (Hit List)

34 全记录页面

35 参考文献了解该合成反应的依据

36 全记录页面

37 被引用情况了解该物质合成的新反应

38 参考文献的“地图”：Palinavir, 抗HIV蛋白酶抑制剂- 合成、衍生物、副反应。。
Beaulieu et al. [Palinavir, synthesis] J.Org.Chem. (1997) Kakuda et al. [administration, adverse effects, HPI] Am.J.Health-System Pharm (1998) Pillay et al. [clinical potential, HPI] Rev.Med.Virology (1995) Fitzsimmons et al. [Saquinavir, HIV, metabolism] Drug Metabolism & Disposition (1998) Vassa et al. [HPI, design] PNAS USA (1994) Kempf et al. [administration, Ritonavir] Antimicrobial Drugs & Agents (1997) Kajiro et al. [Indinavir, synthesis] Synlett (1998) Markovitz et al. [Nelfinavir, pharmacokinetics] J.Infectious Diseases (1998)

39 ? 谢谢！ ? ? ?