对进化论嗤之以鼻的人通常会提出这样的问题：如果人类是从猴子进化而来，那为什么现在还有猴子呢？这个问题透露出大家对于进化如何发生的一个普遍误解。在这种特殊情况下，答案取决于“猴子”是什么意思。
简单回答：人类并非从现代猴子进化而来；事实上，人类和现代猴子都是从一个已经灭绝的共同祖先（我们所说的“猴子”）进化而来的。
在地球上生活过的所有物种的进化家谱中，人类和现代猴子是亲密的表亲。
“如果人类进化自猴子，那怎么还会有猴子？”这个问题，暴露出一个常见的误解——新物种如何进化。这个问题似乎假定了任何新物种总是会替代它的亲本物种，混淆了：（a）亲本物种总是完全演变为后代物种；（b）后代物种总是胜过亲本物种，并驱使它们灭绝。然而这都不正确。如果正确的话，地球上的物种总数就永远不会增加了，物种的“家谱”不会是一棵树，而会是一个完全分离的后代的巨大集合。其实，亲本物种可以产生多个子物种，从而启动后代物种的整个“家谱”。
在现有物种中的相对较小的亚群以某种方式孤立出来时，就会出现新物种。并且，它们在遗传上与亲本种群分化。
具体的要因情况而异，但是这种遗传分歧的主要原因，就像达尔文“适者生存”所说，两个群体要努力适应其不同的环境。但即使环境中的选择压力非常相似，但两个群体彼此隔离的事实就意味着一些遗传分歧必然发生。两个不同群体的遗传组成的随机变化，意味着它们将在世代之间不断遗传、再遗传。
如果两个群体继续分化，并且保持足够独立以防止杂交，它们彼此最终将变得非常不同，使得再也不会被认为是相同的物种。分离导致分化、分化导致物种形成。
可以很合理地认为，如果现代的旧世界猴子是“猴子”，现代的新世界猴子是“猴子”，那么任何起源于它们最近的共同祖先的物种也必定是“猴子”。但是，正如我们所看到的，这其中包括我们人类。所以，人类不仅是从猴子进化来的，甚至现在仍然是猴子！
不过，也可以同样合理地从猴子的定义中排除人类（和猿）。这时，我们所说的“猴子”（用于指现代旧世界和现代新世界猴子，但不是人类或猿）在科学上就变得没有意义。如此的话，原来的问题也没意义了：因为科学地讲，根本没有“猴子”这样的东西！
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